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国家基因库

拟于2016年9月22日举行开业仪式

2016年9月22日  中国 深圳 大鹏

国家基因库主体工程已经建成,于6月18日启动试运行。现拟于2016年9月22日在国家基因库大鹏基地隆重举行开业仪式。届时,我们将邀请众多业界专家、重要合作伙伴出席本次启动仪式,一起见证这历史时刻。

国家基因库,是国家级公益性创新科研及产业基础设施的重大项目,是为国家生命科学研究和生物产业发展提供基础性服务的公益性平台。历时五年准备,国家基因库在生物样本资源存储、基因测序、数据库建设、基因合成、基因编辑及产业应用等方面,已经取得了显著成绩,多项指标处于国际领先水平。国家基因库将融合近年来生命科学学科前沿新态势,结合国际发展新动向,形成 “三库两平台”结构及功能,形成从资源到科研、产业的全贯穿全覆盖的模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。

Cancer Database(癌症数据库)

癌症数据库收集了25种癌症数据,近3000份样本数据,近5万条变异信息等。从疾病、基因、突变、捐赠者等多个维度可视化的展示癌症数据,全面、系统、分层次的展示癌症与基因之间的关系。并且应用具有疾病类数据库特点的生命时间轴来展示癌症样本和数据。并对数据库中的癌症数据进行平行比较、交叉和统计分析,揭示癌症与基因和变异的关系。

http://db.cngb.org/cancer/

出生缺陷数据库

出生缺陷数据库汇集了染色体、单基因病等出生缺陷遗传疾病信息和大量的病例资料,包含341种出生缺陷疾病信息,1195份样本数据,相关基因898个。用户可以便捷的检索到相关的出生缺陷疾病信息及同种疾病其他患者的可公开信息,如检测方法,治疗效果和疾病预后等情况。通过知识学习和同类患者类比等方式全方位了解和认识出生缺陷疾病,并..

http://db.cngb.org/birth/

GEMAP(人类基因组数据库)

数据库收集了来自18个国家的27不同人种的基因组数据,以及来自6个权威数据库数据,38,659个基因、上亿条突变数据和地域信息等,并将其可视化的直观展现。数据库还提供个人基因组数据可视化比较分析,类似google地图一样,用户可方便、快捷、准确、全局或局部直观的搜索和展示个人基因组数据的变异信息以及与其他人种基因组数据的比较信息。

http://db.cngb.org/gemap/home/

1KITE Database(1000种昆虫数据库)

1KITE数据库是基于“千种昆虫转录组进化”项目数据建立的生物信息数据库,该数据库设计理念是将物种、样本、基因、数据、文献等生物数据元素在底层设计成网状结构,在每种数据元素中都会链接到并可以快速检索到其他数据元素的信息,形成数据查询和检索的闭环。该数据库还整合了生物信息数据流的理念,用户可以方便的追溯到数据的上下游..

http://db.cngb.org/1kite/

BLAST4OneKP(千种植物数据库)

千种植物数据库是基于千种植物(OneKP项目)转录组项目数据建立的生物数据库,用户可以方便的通过植物物种树查询和浏览千种植物信息,该数据库还构建了在线Blast平台,提供在线Blast服务。




https://www.bioinfodata.org/Blast4OneKP/home

B10K(鸟类数据库)

目前该数据库收集整理了48只鸟类物种的基因组测序、组装和全基因组比较分析数据,囊括了现代鸟类的主要分枝。基于全基因组数据构建了有史以来最高可信度鸟类分子演化树,前所未有的解决了对早期鸟类演化关系历史争论;并描述了鸟类基因组演化的历程,从基因组的角度阐述了鸟类宏观演化的重要特征。


http://b10k.genomics.cn/

谷子数据库

谷子数据库是基于深圳华大基因研究院和张家口市农业科学院等单位谷子基因组研究项目数据设计,该数据库创新的将谷子的表型和基因型贯穿起来,通过谷子的表型信息可以查询和检索谷子的基因型信息,通过基因型可以查到对应的表型信息。数据库的另一个特色是基于生物大数据的技术,利用数据库2000多份谷子材料,记录的40种左右的谷子表型信..

http://db.cngb.org/millet/

2016年6月20-24日,全球基因组生物多样性联盟(Global GenomeBiodiversity Network, GGBN)2016年年会在德国柏林举行。国家基因库执行主任徐讯全程参与,并做了题为“BiodiversityBiobanking in China National GeneBank: from single biobank to international networks”的主题报告,向全球与会成员介绍了国家基因库各方面的建设和发展情况,并代表国家基因库正式成为其执行委员会(Executive Committee)成员。

GGBN源于2011年由史密斯协会等发起的全球基因组倡议(Global Genome Initiative,GGI)。该倡议活动于2012年成立了临时国际指导委员会,国家基因库作为其重要成员,推动了GGBN的形成和规范化建设。2015年,国家基因库成为该联盟的Associate Member。目前,国家基因库已积极参与该联盟所推动的三个行动任务组(Task Forces)的多项建设任务。

这3个行动组分别负责:1) 制定和统一基因组样本的数据标准和数据存取(Data Standards and DataAccess for Genomic Samples)规则;2)制定基因组样本的管理和处理的政策和实践标准(Policies and Practices Related to Management and Stewardship of Genomic Samples);3) 推广和拓展新会员(Marketing and Outreach)。

通过参与这些建设任务,一方面不断实现GGBN的发展目标;更为重要的是,不断推进自身的能力建设和发展,共同提高两方在全球范围内的影响力。

背景介绍:

GBN是由多家世界顶级或规模比较大的生物资源样本库、研究机构等形成的大规模生物多样性联盟。旨在利用这个国际网络,更好地长期管理用来进行基因组研究的生物样本组织的采集、处理和保存工作;为全球的生物多样性资源库提供一个合作的平台、一个有信誉并且透明的获得基因组样本的通路,从而更好服务于生物多样性资源的研究、发展和保存。这个网络将加强世界各地的样本库在分子生物多样性方面的合作,共同确保形成一致的生物样本质量标准规范、最佳实践标准规范、互用性规范、以及在国家内部和国际法律条文和传统规范的制约下更好地协调生物标本材料的交换和使用。截止目前,该联盟已囊括了来自全球17个国家的50多家生物多样性资源库。

www.ggbn.org

2016年8月,国家基因库E-BioBank平台(简称“EBB平台”)全新改版上线啦!EBB平台致力于在生物样本库及生物多样性资源库领域建立全球生物样本库目录、整合国内外资源、制定统一规范的资源信息整合体系,并创造公平、可靠的资源样本信息共享环境,从而促进样本资源科学合理地利用。

网站改版新增模块特点:

  • 增加了生物多样性“资源样本信息、样本库目录、项目资源”等相关内容;
  • 从样本总量、疾病类型、物种数量、科研项目及组学数据情况等方面全方位实时展示了现有信息数据;
  • 与国家基因库生物信息数据中心同步对接,实现了从样本信息、表型数据到基因数据的贯穿。目前已对接国家基因库“小米数据库”;
  • 更快更方便地查找样本与项目;

目前EBB平台已共享人类遗传资源样本信息11.5万份,生物多样性资源样本信息44.3万份,并且已有23家国内外机构加入样本库目录。用户可以通过EBB平台共享或申请使用样本资源,也可加入样本库目录展示样本库基本情况。 通过样本共享和开放数据库的应用,EBB平台正创建一个“共有”、“共为”、“共享”的生物样本库生态圈。

http://ebiobank.cngb.org/

2016年6月18日上午,广东省省委副书记、深圳市委书记马兴瑞,广东省副省长袁宝成,深圳市市长许勤一行来到位于深圳市大鹏新区大鹏街道下沙片区“禾塘仔”地块的深圳国家基因库,参观了已经建设完成并即将正式投入使用的国家基因库主体建筑 . .

cngb.org/index.php?g=Content&m=News&a=dynamicText&id=237

2016年7月20日,来自哥本哈根大学、中国国家基因库、美国史密森尼学会和中国科学院昆明动物研究所的研究者在《自然通讯》发表真菌蚂蚁最新研究成果,揭示了蚂蚁与真菌共同适应性的分子基础 . . .


cngb.org/index.php?g=Content&m=News&a=dynamicText&id=239

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